专科医学院和本科医学院学制不同、录取分数不同、学习方向不同、就业方向不同、就业后职称不同。总的来说，本科医学院毕业后的学生在工作中的薪资待遇更好，个人的提升空间也很大。
一、学制不同
专科医学院的学制一般是3年制；本科医学院的学制一般是5年制。
二、录取分数不同
专科录取分数线一般与专科学院的录取分数差不多，在专科批次中录取；本科医学院的录取分数要高于本科分数线以上，一些好的医学院的录取分数甚至比一本分数线还要高。
三、学习方向不同
专科医学院更注重培养学生的实际操作能力；本科医学院不仅注重学生的医学实践能力，更注重学生的医学理论基础。
四、就业方向不同
专科医学院的学生毕业后大部分只能从最基础的护士或者其他的底层岗位做起，就业压力比较大；本科医学院的学生毕业后，如果能力深厚者可以去医疗机构从事医学的科研工作，也可以去大医院实习。
五、就业后职称不同
专科医学院毕业后的学生只能考取助理医师证，如果想要考取更高层次的证书，就需要积累工作经验或者提升自己的学历；本科医学院毕业后的学生可以考取执业医师资格证。